Cơ cấu tổ chức bộ máy của Sở Kế hoạch và Đầu tư gồm có: Giám đốc, các phó giám đốc, Văn phòng, Thanh tra,các phòng chuyên môn, nghiệp vụ và trung tâm Xúc tiến đầu tư.
1. Lãnh đạo Sở:
Lãnh đạo Sở Kế hoạch và Đầu tư tỉnh gồm 01 giám đốc và 03 phó giám đốc.
Giám đốc Sở là người đứng đầu Sở, chịu trách nhiệm trước UBND tỉnh, trước pháp luật về toàn bộ hoạt động của Sở và việc thực hiện nhiệm vụ được giao, chịu trách nhiệm và báo cáo công tác trước UBND tỉnh, Bộ Kế hoạch và Đầu tư và HĐND Tỉnh khi được yêu cầu.
Các Phó giám đốc giúp Giám đốc và chịu trách nhiệm trước Giám đốc, trước pháp luật về lĩnh vực công tác được phân công.
2. Cơ cấu tổ chức của Sở:
2.1. Văn phòng;
2.2. Thanh tra;
2.3. Các phòng chuyên môn nghiệp vụ:
- Phòng Tổng hợp kinh tế quốc dân;
- Phòng Công nghiệp – Thương mại;
- Phòng Nông nghiệp và Phát triển nông thôn;
- Phòng Văn xã;
- Phòng Đăng ký kinh doanh;
- Phòng Kinh tế đối ngoại và Xúc tiến đầu tư.
2.4 Trung tâm Xúc tiến đầu tư
3. Biên chế của Sở Kế hoạch và Đầu tư:
Căn cứ vào chức năng, nhiệm vụ của Sở, vào khối lượng công việc, vào điều kiện thực tế của tỉnh và chức danh, tiêu chuẩn ngạch công chức theo qui định của pháp luật, tổng biên chế của Sở Kế hoạch và Đầu tư tối đa không quá 45 biên chế.
Trung tâm Xúc tiến đầu tư gồm 11 viên chức